PDBCharges byl publikován v článku
V časopise Nucleic Acids Research byl publikován nástroj PDBCharges, který poskytuje parciální atomové náboje pro proteinové struktury z Protein Data Bank.
Dne 31. května naše kolegyně Veronika Horská úspěšně obhájila disertační práci na katedře matematiky a statistiky Přírodovědecké fakulty Masarykovy univerzity. Téma její disertační práce zní „Statistická inference v analýze přežití s využitím R a aplikace Shiny“.
Práce se týká tématu analýzy přežití a její aplikace širší vědecké komunitě. Po důsledném a zároveň srozumitelném vymezení příslušných matematických základů Veronika napsala uživatelsky přívětivý text o tvorbě webové aplikace pomocí jazyka R a frameworku Shiny. Tento text pak použila k vytvoření aplikace ShinySAR, což je soukromá aplikace, která poskytuje interaktivní pohled na data ze Slovenského atroplastického registru. Aplikace a způsob jejího nasazení na server jsou v práci obsáhle zdokumentovány.
Gratulujeme, Veroniko!
V časopise Nucleic Acids Research byl publikován nástroj PDBCharges, který poskytuje parciální atomové náboje pro proteinové struktury z Protein Data Bank.
Ondřej Schindler ze skupiny Strukturní bioinformatika povede workshop zaměřený na úvod do optimalizace struktur molekul, kde se seznámíte s klíčovými pojmy a teoriemi, včetně silových polí, kvantové chemie a molekulové dynamiky.