PDBCharges byl publikován v článku
V časopise Nucleic Acids Research byl publikován nástroj PDBCharges, který poskytuje parciální atomové náboje pro proteinové struktury z Protein Data Bank.
Radka Svobodová, vedoucí skupiny Strukturní bioinformatika, pořádala ve dnech 12. až 14. února workshop s názvem Softwarové nástroje pro strukturní bioinformatiku. Cílem akce bylo seznámit účastníky s klíčovými kroky v procesu analýzy biomolekulárních struktur a vybavit je praktickými dovednostmi v oblasti jejich zpracování.
Workshop se zaměřil na procesy vyhledávání, vizualizace a validace biomolekulárních struktur, stejně jako na analýzu biologicky významných ligandů. Účastníci měli možnost pracovat s řadou specializovaných nástrojů pro analýzu strukturních dat, jako jsou Mol*, 2DProts, ACC2, αCharges, MOLEonline, ChannelsDB a další, které si vyzkoušeli v praktických cvičeních.
Děkujeme všem účastníkům za jejich aktivní účast a těšíme se na viděnou na podobných akcí v budoucnu.
V časopise Nucleic Acids Research byl publikován nástroj PDBCharges, který poskytuje parciální atomové náboje pro proteinové struktury z Protein Data Bank.
Ondřej Schindler ze skupiny Strukturní bioinformatika povede workshop zaměřený na úvod do optimalizace struktur molekul, kde se seznámíte s klíčovými pojmy a teoriemi, včetně silových polí, kvantové chemie a molekulové dynamiky.