PDBCharges byl publikován v článku
V časopise Nucleic Acids Research byl publikován nástroj PDBCharges, který poskytuje parciální atomové náboje pro proteinové struktury z Protein Data Bank.
Jedenáct závěrečných prací úspěšně obhájených na jaře 2025
V posledních čtrnácti dnech, na konci jarního semestru roku 2025, jedenáct našich kolegů úspěšně obhájilo své závěrečné práce. Práce byly obhájeny jak na Přírodovědecké fakulte, tak na Fakultě informatiky.
Na Fakultě informatiky Eduard Ruisl obhájil diplomovou práci na téma „Structural Bioinformatics Application Platform“. Ján Kučera obhájil diplomovou práci na téma „Návrh a implementácia automatického ukladania dát v ChannelsDB“. Martin Pilát obhájil diplomovou práci na téma „Design and implementation of a new architecture for the Atomic Charge Calculator II“. David Konečný obhájil diplomovou práci na téma „Acquisition of research data from specialised instruments“. Jan Bříza obhájil diplomovou práci na téma „Calculations of partial atomic charges by machine learning methods“.
Jakub Plhal obhájil bakalářskou práci na téma „GOLEM application back end“. Patrik Roháč obhájil bakalářskou práci na téma „Data downsampling for Mol* VS“. Marek Eibel obhájil bakalářskou práci na téma „VRML to STL mesh format converter for Mol* VS“. Andrej Gáfrik obhájil bakalářskou práci na téma „Sprístupnenie dát uložených v systéme Onedata pomocou aplikácie pre systém Windows“.
Na Přírodovědecké fakultě Lukáš Bohuš obhájil závěrečný projekt na téma „Opravování proteinových struktur z AlphaFold DB“. Margarita Marsova obhájila závěrečný projekt na téma „Analýza IDR v rámci transkriptomu“.
Všem jedenácti kolegům gratulujeme!
