Výzkumná skupina Strukturní bioinformatika

Zaměření výzkumu a ambice

Vítejte na stránkách výzkumné skupiny Strukturní bioinformatika. Naše výzkumná skupina spadá pod Národní centrum pro výzkum biomolekul Přírodovědecké fakulty Masarykovy univerzity.

V našem výzkumu se zaměřujeme na analýzu proteinových struktur, proteinových fragmentů a celých proteinových rodin. Konkrétně vizualizujeme, validujeme a anotujeme proteinové struktury, detekujeme kanály a fragmenty v proteinech a počítáme vlastnosti proteinů. Souběžně vyvíjíme také softwarové nástroje pro provádění těchto analýz. Náš software je integrován do klíčových strukturních bioinformatických databází, jako jsou Protein Data Bank a CATH.

Hledáme nové členy, stážisty, studenty i postdocy. Výzkum v oblasti strukturní bioinformatiky je v dnešní době klíčový pro rozvoj vědních disciplín, jako jsou vývoj léčiv či moderní diagnostika. Staňte se součástí naší výzkumné skupiny a podílejte se na výzvách, které tento výzkum přináší.

Připojte se k naší výzkumné skupině

Aktuality

23. 9.

V rámci projektu Optimalizace proteinových struktur predikovaných AI byly publikovány tři práce

Spolupráce NCBR PřF MU a CESNET vedla ke vzniku sady nástrojů PROPTIMUS pro opravu a optimalizaci proteinových struktur predikovaných AI.

8. 9.

Úspěšně obhájená disertační práce

Dne 3. září naše kolegyně Gabriela Bučeková úspěšně obhájila disertační práci na Přírodovědecké fakultě Masarykovy univerzity. Téma její disertační práce zní „Bioinformatická analýza vlastností bílkovin“.

20. 8.

ACC III na titulní straně NAR WS 2026

Atomic Charge Calculator III, vyvinutý výzkumnou skupinou Strukturní bioinformatika, byl publikován v NAR Web Server Issue 2026 a objevil se i na titulní straně čísla.

VŠECHNY AKTUALITY

Náš software

Mol*

Vysoce výkonná grafika a zpracování dat v prohlížeči umožňuje Mol* současně vizualizovat až stovky (superponovaných) proteinových struktur, přehrávat trajektorie molekulární dynamiky, vykreslovat modely na úrovni buněk v atomárních detailech s desítkami milionů atomů.

Atomic Charge Calculator III

Atomic Charge Calculator III (ACC III) je aplikace pro rychlý výpočet parciálních atomových nábojů. Obsahuje 20 empirických metod spolu s parametry z literatury.

ChannelsDB 2.0

ChannelsDB 2.0 je komplexní a pravidelně aktualizovaný zdroj kanálů, pórů a tunelů v biomakromolekulách uložených v databázích Protein Data Bank a AlphaFill / AlphaFold. Jedná se tak o jedinečnou službu pro analýzy související s tunely.

Úspěchy

>0

publikací od roku 2021

>0

absolventů

Zajímá tě náš výzkum? Přidej se k nám!

Jsi student a chceš získat praktické zkušenosti? Neváhej a přidej se k nám! Podívej se na dostupná témata závěrečných prací nebo nás kontaktuj na radka.svobodova@mail.muni.cz nebo tomas.racek@muni.cz.