V rámci projektu Optimalizace proteinových struktur predikovaných AI byly publikovány tři práce
Spolupráce NCBR PřF MU a CESNET vedla ke vzniku sady nástrojů PROPTIMUS pro opravu a optimalizaci proteinových struktur predikovaných AI.
Úspěšně obhájená disertační práce
Dne 3. září naše kolegyně Gabriela Bučeková úspěšně obhájila disertační práci na Přírodovědecké fakultě Masarykovy univerzity. Téma její disertační práce zní „Bioinformatická analýza vlastností bílkovin“.
Tato disertační práce se zabývá analýzou vybraných vlastností proteinů a jejich ligandů pomocí výpočetních metod. První část se zaměřuje na konformace cyklů v ligandech proteinů a jejich analýzu na rozsáhlém souboru struktur. Druhá část se věnuje vývoji a aplikaci nástroje MOLEonline pro analýzu proteinových tunelů a pórů. Třetí část se zabývá výpočtem a analýzou parciálních atomových nábojů pomocí nástroje PDBCharges. Poslední část se zaměřuje na metadata simulací molekulární dynamiky a vývoj nástroje GROMACS MetaDump pro jejich automatickou extrakci.
Gratulujeme!
