Radka Svobodová byla jmenována profesorkou
Vedoucí výzkumné skupiny Strukturní bioinformatika, Radka Svobodová, převzala 1. června 2026 jmenovací dekret profesorky.
Ondřej Schindler, člen skupiny Strukturní bioinformatika, povede workshop zaměřený na úvod do optimalizace struktur molekul, kde se seznámíte s klíčovými pojmy a teoriemi, včetně silových polí, kvantové chemie a molekulové dynamiky. V praktickém cvičení se naučíte používat software xtb pro optimalizaci molekulárních struktur a interpretaci výsledků, přičemž si budete moci připravit vlastní struktury k optimalizaci.
Workshop je úvodem do problematiky optimalizací struktur molekul. Během první přednášky probereme základní pojmy týkající se obecné optimalizace. V rámci druhé přednášky získané znalosti o optimalizacích aplikujeme na optimalizace struktur molekul a zmíníme dostupné úrovně teorie, kterými lze molekulu popsat (silová pole, metody kvantové chemie, molekulová dynamika). Následně představíme softwarový balík xtb, určený pro optimalizaci struktur molekul. V rámci praktického cvičení se tento software naučíme spustit a interpretovat výsledky. Posluchači si také mohou připravit vlastní struktury, které by chtěli v rámci cvičení optimalizovat.
Vedoucí výzkumné skupiny Strukturní bioinformatika, Radka Svobodová, převzala 1. června 2026 jmenovací dekret profesorky.
V časopise Nucleic Acids Research byl publikován nástroj Atomic Charge Calculator III, který slouží k výpočtu parciálních atomové náboje pro různé molekulární systémy, včetně malých organických molekul a proteinů.