PDBCharges byl publikován v článku
V časopise Nucleic Acids Research byl publikován nástroj PDBCharges, který poskytuje parciální atomové náboje pro proteinové struktury z Protein Data Bank.
V červnu letošního roku čtyři naši kolegové úspěšně obhájili své záverečné práce.
Viktoriia Doshchenko obhájila diplomovou práci na Přírodovědecké fakultě Masarykovy univerzity. Téma její diplomové práce zní „Workflow for validation of ring conformation“. Po tomto úspěchu se Viktoriia rozhodla zůstat v naší výzkumné skupině jako doktorandka. Bude pracovat na tématu své doktorské práce „Vývoj pracovního postupu z analýzy struktury proteinů“.
Jana Porubská a Gabriela Bučeková, naše kolegyně doktorandky, se rozhodly rozšířit si obzory v bioinformatice. Vyvrcholením jejich snažení byla úspěšná obhajoba bakalářských prací na Přírodovědecké fakultě Masarykovy univerzity. Téma diplomové práce Jany je „Validation of ring conformations in polycyclic molecules“, téma diplomové práce Gabriely je „Analysis of a relation between protein structure quality and publication sources“.
Čtvrtým z našich úspěšných kolegů je Kamil Jelínek, který obhájil bakalářskou práci na Přírodovědecké fakultě Masarykovy univerzity. Tématem jeho práce je „Analýza kvality predikce poloh atomů vodíku v proteinech“.
Všem čtyřem našim kolegům gratulujeme: Viktorii, Janě, Gabriele a Kamilovi!
V časopise Nucleic Acids Research byl publikován nástroj PDBCharges, který poskytuje parciální atomové náboje pro proteinové struktury z Protein Data Bank.
Ondřej Schindler ze skupiny Strukturní bioinformatika povede workshop zaměřený na úvod do optimalizace struktur molekul, kde se seznámíte s klíčovými pojmy a teoriemi, včetně silových polí, kvantové chemie a molekulové dynamiky.