Náš kolega Adrian Rošinec se nedávno zúčastnil konference BioExcel, kde prezentoval poster o výzvách a možnostech v oblasti správy dat molekulárních dynamik (MD). Ve své prezentaci zdůraznil limity metadat při identifikaci a porovnávání komplexních MD trajektorií a zdůraznil potřebu pokročilých metod podobnostního vyhledávání.
Na posteru ukázal, jak může pomocí embeddingu transformovat MD trajektorie do kompaktních vektorů, díky čemuž lze nad daty vyhledávat, a odhalovat tak funkční podobnosti a dynamické chování nad rámec metadat. Adrianova práce, inspirovaná nástroji, jako je AlphaFind [1,2], má za cíl zlepšit schopnost MD komunity efektivně analyzovat a interpretovat rozsáhlá simulační data.
Ondřej Schindler ze skupiny Strukturní bioinformatika povede workshop zaměřený na úvod do optimalizace struktur molekul, kde se seznámíte s klíčovými pojmy a teoriemi, včetně silových polí, kvantové chemie a molekulové dynamiky.
Radka Svobodová, vedoucí skupiny Strukturní bioinformatika, pořádala ve dnech 12. až 14. února workshop s názvem Softwarové nástroje pro strukturní bioinformatiku.
