PDBCharges byl publikován v článku
V časopise Nucleic Acids Research byl publikován nástroj PDBCharges, který poskytuje parciální atomové náboje pro proteinové struktury z Protein Data Bank.
Naše kolegyně Romana Gáborová se nedávno stala spoluautorkou článku, který vyšel v evropské databázi Protein Data Bank (PDB). Článek se zabývá současnou praxí anotace (nebo ve většině případů její absencí) makromolekulárních komplexních sestav. Autoři navrhují metodu popisu asambláží a jejich obohacení o relevantní biologický kontext. Důležitým přínosem předloženého přístupu je zlepšení FAIR atributů v PDB.
Článek „Annotating Macromolecular Complexes in the Protein Data Bank: Improving the FAIRness of Structure Data“ byl publikován v časopise Scientific Data.
V časopise Nucleic Acids Research byl publikován nástroj PDBCharges, který poskytuje parciální atomové náboje pro proteinové struktury z Protein Data Bank.
Ondřej Schindler ze skupiny Strukturní bioinformatika povede workshop zaměřený na úvod do optimalizace struktur molekul, kde se seznámíte s klíčovými pojmy a teoriemi, včetně silových polí, kvantové chemie a molekulové dynamiky.