Gromacs MetaDump byl publikován v Journal of Cheminformatics
V časopise Journal of Cheminformatics byl publikován nástroj Gromacs MetaDump, který automaticky anotuje výstupní soubory z MD simulací GROMACS.
Naše kolegyně Romana Gáborová se nedávno stala spoluautorkou článku, který vyšel v evropské databázi Protein Data Bank (PDB). Článek se zabývá současnou praxí anotace (nebo ve většině případů její absencí) makromolekulárních komplexních sestav. Autoři navrhují metodu popisu asambláží a jejich obohacení o relevantní biologický kontext. Důležitým přínosem předloženého přístupu je zlepšení FAIR atributů v PDB.
Článek „Annotating Macromolecular Complexes in the Protein Data Bank: Improving the FAIRness of Structure Data“ byl publikován v časopise Scientific Data.
V časopise Journal of Cheminformatics byl publikován nástroj Gromacs MetaDump, který automaticky anotuje výstupní soubory z MD simulací GROMACS.
V časopise Bioinformatics byl publikován nástroj MOLEonline, který detekuje a analyzuje tunely a póry v proteinových strukturách.