Vítejte na stránkách výzkumné skupiny Strukturní bioinformatika. Naše výzkumná skupina spadá pod Národní centrum pro výzkum biomolekul Přírodovědecké fakulty Masarykovy univerzity.
V našem výzkumu se zaměřujeme na analýzu proteinových struktur, proteinových fragmentů a celých proteinových rodin. Konkrétně vizualizujeme, validujeme a anotujeme proteinové struktury, detekujeme kanály a fragmenty v proteinech a počítáme vlastnosti proteinů. Souběžně vyvíjíme také softwarové nástroje pro provádění těchto analýz. Náš software je integrován do klíčových strukturních bioinformatických databází, jako jsou Protein Data Bank a CATH.
Hledáme nové členy, stážisty, studenty i postdocy. Výzkum v oblasti strukturní bioinformatiky je v dnešní době klíčový pro rozvoj vědních disciplín, jako jsou vývoj léčiv či moderní diagnostika. Staňte se součástí naší výzkumné skupiny a podílejte se na výzvách, které tento výzkum přináší.
Vysoce výkonná grafika a zpracování dat v prohlížeči umožňuje Mol* současně vizualizovat až stovky (superponovaných) proteinových struktur, přehrávat trajektorie molekulární dynamiky, vykreslovat modely na úrovni buněk v atomárních detailech s desítkami milionů atomů.
Atomic Charge Calculator II (ACC II) je aplikace pro rychlý výpočet parciálních atomových nábojů. Obsahuje 20 empirických metod spolu s parametry z literatury.
ChannelsDB 2.0 je komplexní a pravidelně aktualizovaný zdroj kanálů, pórů a tunelů v biomakromolekulách uložených v databázích Protein Data Bank a AlphaFill / AlphaFold. Jedná se tak o jedinečnou službu pro analýzy související s tunely.
Jsi student a chceš získat praktické zkušenosti? Neváhej a přidej se k nám! Podívej se na dostupná témata závěrečných prací nebo nás kontaktuj na radka.svobodova@mail.muni.cz nebo tomas.racek@muni.cz.
