Atomic Charge Calculator III byl publikován v Nucleic Acids Research

Parciální atomové náboje poskytují zjednodušený popis rozložení elektronové hustoty v molekule, které určuje interakce s okolním prostředím.

Proto výzkumná skupina Strukturní bioinformatika vyvinula webovou aplikaci Atomic Charge Calculator III (ACC III), která slouží pro výpočet parciálních atomových nábojů pro různé molekulární systémy, včetně malých organických molekul a proteinů. ACC III navazuje na předchozí verze a implementuje 20 široce používaných empirických metod výpočtu nábojů, včetně nejmodernějšího přístupu SQE+qp s aktualizovanými parametry. Platforma integruje moderní prohlížeč Mol* pro interaktivní vizualizaci a podporuje ukládání vypočítaných nábojů přímo do souborů mmCIF s využitím formálně definovaného rozšíření, což umožňuje sdílení výsledků ve standardním formátu.

ACC III byl nedávno publikován v časopise Nucleic Acids Research v článku Atomic Charge Calculator III: a modern platform for calculating partial atomic charges.